El Tribunal Supremo avala que Hacienda revise el origen de un saldo de IVA a compensar aunque el trimestre que lo generó haya prescrito ya. La sentencia 988/2026, de 23 de julio, permite a la Agencia Tributaria comprobar tanto el importe como la procedencia de ese crédito fiscal mientras siga teniendo efectos sobre declaraciones posteriores.
La consecuencia es muy concreta para quien arrastra IVA a compensar: el plazo de revisión puede pasar de cuatro años a diez. Y no afecta a todos por igual. Un autónomo que ingresa todo su IVA cada trimestre y nunca deja saldo pendiente no tiene nada que temer. Quien acumula cuotas soportadas por encima de las que repercute a sus clientes, sí.
Qué dice exactamente la sentencia sobre los saldos de IVA
El caso que llegó al Supremo tuvo como protagonista a la sociedad Anuda Gestión, con liquidaciones de los ejercicios 2015, 2016, 2017 y 2018. Hacienda reconoció que parte de los trimestres de 2015 ya habían prescrito y que no podían modificarse. Pero había un detalle que lo cambiaba todo: parte de esos saldos se había trasladado a ejercicios posteriores.
La empresa sostenía que la prescripción blindaba también las operaciones que originaron aquellos importes. El Supremo responde con una distinción que conviene entender: una cosa es liquidar otra vez un período ya prescrito, y otra muy distinta comprobar un crédito fiscal que continúa utilizándose después. Lo primero ya no cabe. Lo segundo, sí.
Traducido al día a día: Hacienda no va a girar una liquidación nueva por el IVA de un trimestre de hace cinco años. Lo que sí puede hacer es pedirte las facturas que demuestran que ese saldo que aplicas ahora existe de verdad y nació como dices.
Cuándo Hacienda puede remontarse diez años en lugar de cuatro
Con carácter general, la Administración dispone de cuatro años para determinar una deuda tributaria mediante una liquidación. Pasado ese tiempo, y salvo que alguna circunstancia interrumpa la prescripción, ese derecho se pierde. Es la regla que la mayoría de autónomos tiene interiorizada y de la que se fía al vaciar el archivador.
No es que Hacienda tenga diez años para revisar cualquier IVA: lo que puede hacer es auditar un saldo antiguo mientras siga vivo en tus declaraciones.
El matiz está en el artículo 66 bis de la Ley 58/2003, General Tributaria, que fija un plazo de diez años para comprobar determinadas bases, cuotas o deducciones compensadas o pendientes de compensación. El reloj arranca el día siguiente a aquel en que terminaba el plazo reglamentario para presentar la declaración en la que nació ese derecho.
Ahí está la clave y ahí está también el malentendido más frecuente. Que un trimestre prescriba no borra el crédito. Un trimestre puede haber prescrito y resultar imposible modificar su liquidación, pero el crédito fiscal nacido entonces puede continuar sujeto a comprobación si todavía se está empleando.
Y ojo, porque esto es contraintuitivo: el saldo no es un derecho intocable por el mero paso del tiempo. Si lo usas, sigue vivo. Y si está vivo, Hacienda puede preguntarte por él.
Qué documentación conservar y qué pasa si ya no la tienes
Un ejemplo ayuda a aterrizarlo. Imagina que cierras un trimestre con 20.000 euros de IVA pendiente de compensar porque tus cuotas soportadas deducibles superaron al IVA que repercutiste. En los años siguientes vas tirando de ese saldo y, cuando el período original prescribe, todavía te quedan 8.000 euros, que aplicas después para rebajar una declaración en la que te tocaba ingresar.
Hacienda no puede reabrir aquel trimestre para girarte otra liquidación. Lo que sí puede, dentro de los límites legales, es comprobar que esos 8.000 euros son reales y proceden de cuotas deducibles. Si conservas las facturas soportadas, los libros registro y las autoliquidaciones del modelo 303, lo acreditas sin dramas. Si ya no los tienes, el problema es serio.
Aquí está el despiste que más caro sale. Pasados los cuatro años, se tira la documentación del IVA porque se da por hecho que ya no hace falta. Con esta sentencia en la mano, la referencia no son los cuatro años, sino el tiempo que tu saldo siga pendiente de compensar. Puedes consultar el saldo vivo en la sede electrónica de la AEAT con certificado digital o Cl@ve.
Por qué esta sentencia importa más de lo que parece
No es doctrina aislada. El Supremo lleva tiempo afinando la frontera entre lo prescrito y lo que sigue produciendo efectos fiscales, y esta resolución consolida una idea: la prescripción protege la liquidación del período, no borra el crédito que nació en él. Para la AEAT es una puerta abierta a revisar arrastres antiguos. Para el autónomo, un recordatorio de que la seguridad jurídica tiene letra pequeña.
Hay una lectura crítica razonable. La Administración refuerza su capacidad de comprobación en un terreno donde el obligado rara vez conserva papeles de hace una década. Quien más arrastra saldos —actividades con mucho IVA soportado, negocio exportador, proyectos con inversión fuerte al arrancar— es justo quien queda más expuesto.
Qué mirar desde ahora. Revisa si tienes saldo pendiente de compensar en tus últimas autoliquidaciones. Si lo hay, no borres nada. Y si tu gestoría te reclama facturas de hace seis u ocho años, es exactamente por esto. La próxima vez que dudes si tirar un archivador, pregúntate si ese IVA sigue apareciendo en tus declaraciones.
Guía rápida del trámite
- 📅 Plazos: No hay plazo de solicitud; Hacienda puede comprobar saldos a compensar hasta diez años desde el fin del plazo de la declaración que los generó.
- ✅ Requisitos clave: Arrastrar saldos de IVA pendientes de compensar, estar dado de alta en el RETA o ser sociedad, y conservar facturas, libros registro y autoliquidaciones.
- 🌐 Dónde solicitarlo: No es un trámite: la comprobación la inicia la AEAT. Consulta de saldos en la sede electrónica de la AEAT con certificado digital o Cl@ve.
- 💰 Importe o coste: Sin coste directo; el riesgo real es perder el saldo si no puedes acreditar su origen y su importe.
- ⚠️ Error a evitar: Destruir facturas y registros pasados los cuatro años cuando aún queda saldo pendiente de compensar.
